隨著《神鬼寓言》重啟版消息的公布，系列原作的一些過(guò)往爭(zhēng)議再度被提及。2016年，外媒GameSpot曾披露，微軟當(dāng)年拒絕了開發(fā)商獅頭工作室將黑人女性作為《神鬼寓言3》封面的提議。

　　這一事件發(fā)生在2010年《神鬼寓言3》開發(fā)末期及宣傳階段。獅頭工作室前美術(shù)總監(jiān)McCormack回憶，微軟當(dāng)時(shí)明確表示封面“不能是黑人，也不能是女性”，堅(jiān)持使用白人形象。McCormack對(duì)此強(qiáng)烈反對(duì)，認(rèn)為游戲允許玩家成為自己想扮演的英雄，封面應(yīng)體現(xiàn)這一精神，但微軟以“知道什么能賣座”為由拒絕了提議，并引用迪士尼電影《公主與青蛙》作為市場(chǎng)接受度的例子。

　　McCormack指出，微軟最終采用的封面是一位傳統(tǒng)白人男性英雄持劍的形象，這完全“誤解了”游戲的核心。他強(qiáng)調(diào)《神鬼寓言3》是首批包含同性婚姻的游戲之一，旨在打破界限，融合趣味與成熟主題，而微軟的決策卻顯得保守且脫離游戲本意。

　　盡管多數(shù)參與《神鬼寓言2》的開發(fā)者對(duì)與微軟的合作表示滿意，認(rèn)為微軟尊重系列的英式幽默風(fēng)格，但McCormack仍因創(chuàng)意分歧感到沮喪。他于2012年離開獅頭，部分原因正是微軟否決了他提出的“更黑暗、更殘酷”的《神鬼寓言4》方案。

　　2016年4月，微軟關(guān)閉了獅頭工作室。據(jù)悉，微軟曾收到多家公司對(duì)獅頭及《神鬼寓言》系列的收購(gòu)要約，但均予以拒絕。